LegalizePar 2.1.3.1.i. investīcijas projekta "Informācijas tehnoloģiju infrastruktūras izveide Latvijas iedzīvotāju references genoma glabāšanai un piekļuves nodrošināšanai" pases apstiprināšanu
Ministru kabineta rīkojums Nr. 81 Rīgā 2023. gada 15. februārī (prot. Nr. 8 34. §)
1. Apstiprināt Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna 2.1.3.1.i. investīcijas projekta "Informācijas tehnoloģiju infrastruktūras izveide Latvijas iedzīvotāju references genoma glabāšanai un piekļuves nodrošināšanai" (turpmāk – projekts) pasi (pielikums) un noteikt finansējuma saņēmēju par atbildīgo par projekta pasē norādīto plānoto rezultātu (tai skaitā finanšu, rezultāta un iznākuma rādītāju) sasniegšanu atbilstoši Ministru kabineta 2022. gada 14. jūlija noteikumu Nr. 435 "Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna 2. komponentes "Digitālā transformācija" 2.1. reformu un investīciju virziena "Valsts pārvaldes, tai skaitā pašvaldību, digitālā transformācija" īstenošanas noteikumi" (turpmāk – Ministru kabineta noteikumi Nr. 435) 28. punktam, kā arī apstiprināt projekta izmaksas – Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma finansējumu investīcijai 954 755 euro apmērā un valsts budžeta finansējumu pievienotās vērtības nodokļa izmaksu segšanai 132 300 euro apmērā.
2. Vides aizsardzības un reģionālās attīstības ministrijai uzaicināt finansējuma saņēmēju – atvasinātu publisku personu "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs" – iesniegt projekta iesniegumu Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna 2. komponentes "Digitālā transformācija" 2.1. reformu un investīciju virziena "Valsts pārvaldes, tai skaitā pašvaldību, digitālā transformācija" 2.1.3.1.i. investīcijas "Datu pieejamība, koplietošana un analītika" (turpmāk – 2.1.3.1.i. investīcija) ietvaros.
3. Projektu finansēt 2.1.3.1.i. investīcijas ietvaros, ja projekta iesniegums atbilst Ministru kabineta noteikumos Nr. 435 iekļautajiem nosacījumiem.
Ministru prezidents A. K. KariņšVeselības ministre L. Meņģelsone
Veselības ministrijas iesniegtajā redakcijāPielikumsMinistru kabineta2023. gada 15. februārarīkojumam Nr. 81
2.1.3.1.i. investīcijas projekta "Informācijas tehnoloģiju infrastruktūras izveide Latvijas iedzīvotāju references genoma glabāšanai un piekļuves nodrošināšanai" pase
| 1.1. Finansējuma saņēmējs, kas īsteno projektu (institūcija) | Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs" (turpmāk – BMC). BMC ir Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes galvenais apstrādātājs saskaņā ar Ministru kabineta 2006. gada 1. novembra rīkojumu Nr. 853 "Par valsts aģentūras "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs" pilnvarošanu vienotas valsts iedzīvotāju genoma datu bāzes izveidošanai un papildināšanai" un saskaņā ar Cilvēka genoma izpētes likuma 4. panta pirmo daļu. |
|---|---|
| 1.2. Projekta īstenošanas partneri | Latvijas Nacionālā bibliotēka (turpmāk – LNB), SIA "Rīgas Austrumu klīniskā universitātes slimnīca" (turpmāk – RAKUS) |
| 2.1. Programmas nosaukums | Datu pārvaldības attīstības programma |
| --- | --- |
| 2.2. Saistība ar citiem projektiem | Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna 4.1.1.r. reformas "Uz cilvēku centrētas, visaptverošas, integrētas veselības aprūpes sistēmas ilgtspēja un noturība" (turpmāk – 4.1.1.r. reforma) projektā "Latvijas iedzīvotāju genoma references izveide" tika iegūta Latvijas iedzīvotāju genoma reference – nodrošināta 3500 Latvijas iedzīvotāju iesaistīšana, ģenētiskā materiāla iegūšana un pilnu genomu sekvencēšana.2.1.3.1.i. investīcijas projektā "Informācijas tehnoloģiju infrastruktūras izveide Latvijas iedzīvotāju references genoma glabāšanai un piekļuves nodrošināšanai" (turpmāk – Projekts) paredzētas atšķirīgas aktivitātes – izveidot nacionālu informācijas un komunikācijas tehnoloģiju (turpmāk – IKT) infrastruktūru un datu apstrādes ietvaru, lai nodrošinātu drošu uzglabāšanu, apstrādi un drošu piekļuvi genoma references datiem, tādēļ nepastāv dubultā finansējuma risks.ES 2014.–2020. gada plānošanas perioda Eiropas Reģionālā attīstības fonda (ERAF) 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 4. kārtas projekts "DECIDE – Dinamiskās informētās piekrišanas sistēmas izveide biobankas un sabiedrības zinātnisko aktivitāšu datu pārvaldībai, kvalitātes kontrolei un integrācijai" (saistība aprakstīta 3.1. punktā). |
| 3.1. Projekta mērķis un galvenais saturs | Projekta mērķis ir nodrošināt Latvijas iedzīvotāju genoma references datu uzglabāšanu un pieejamību veselības aprūpes (profilakse, diagnostika un ārstēšana), pētniecības un inovāciju nolūkos. Paredzēts izveidot nacionālu IKT infrastruktūru un datu apstrādes ietvaru, lai nodrošinātu drošu uzglabāšanu, apstrādi un drošu piekļuvi genoma references datiem, kas iegūti no 3500 Latvijas iedzīvotājiem 4.1.1.r. reformas projektā "Latvijas iedzīvotāju genoma references izveide" un ārstniecības procesā iegūtajiem datiem.Dinamiskās informētās piekrišanas sistēmas funkcionalitāte, kas ir nepieciešama genoma references datu kopas piekrišanu pārvaldībai, tiks veidota daudznomnieku (multi-tenancy) arhitektūrā kā koplietošanas sistēma, kas ļaus to izmantot Latvijas biobankām. Dinamiskās informētās piekrišanas funkcionalitāte tiks ieviesta, pilnveidojot DECIDE sistēmu, kas sākotnēji ir izstrādāta Eiropas Reģionālā attīstības fonda (ERAF) 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 4. kārtas ietvaros īstenotajā projektā "DECIDE – Dinamiskās informētās piekrišanas sistēmas izveide biobankas un sabiedrības zinātnisko aktivitāšu datu pārvaldībai, kvalitātes kontrolei un integrācijai", pilnveidojot DECIDE sistēmu un ieviešot tajā:• Piekrišanu elektroniskās parakstīšanas un zīmogošanas funkcionalitāti;• Ieviešot piekrišanu atsaukšanas funkcionalitāti;• Pārveidojot DECIDE sistēmas arhitektūru un datu struktūru darbam daudznomnieku (multi-tenancy) arhitektūrā.Šāda arhitektūra nodrošinās iespēju elektroniski parakstītas piekrišanas nodot kompetentajām institūcijām atbilstoši spēkā esošajam normatīvajam regulējumam. Ārstniecības iestādēm, kuras, iespējams, nākotnē nodos datus Valsts iedzīvotāju genoma datu informācijas sistēmā (turpmāk – VIGDIS) un Latvijas biobankām dinamiskās informētās piekrišanas funkcionalitāte būs pieejama kā valsts informācijas sistēmas bezmaksas pakalpojums.Tāpat Projektā tiks realizēta:1. VIGDIS sistēmā integrēta statiskās koda analīzes funkcionalitātes izveide automatizēta koda piegādes un uzstādīšanas ietvaros;2. Genoma datņu apstrādes atvērtā koda rīka un augstas veiktspējas resursu integrācija VIGDIS sistēmā genoma datņu apstrādes un konvertācijas koplietošanas pakalpojuma izveidei, kas ir nepieciešama nestrukturētu genoma sekvences datu sagatavošanai datu analīzei. Pakalpojums būs pieejams gan ārstniecības personālam, gan pētniekiem;3. Variantu pārlūkošanas un atlases atvērtā koda rīka integrācija koplietošanas pakalpojuma izveide, kas būs pieejama ārstiem ģenētiķiem potenciālo slimību izraisošo variantu atlasei VIGDIS sistēmā esošo genoma datu izmantošanai ārstniecībā, kā arī variantu atlasei pētniecības procesā. Pakalpojums būs pieejams gan ārstniecības personālam, gan pētniekiem. |
| --- | --- |
| 3.2. Projekta pamatojums (aktualitāte/nepieciešamība/risināmā problēma) | Latvija ir pievienojusies Eiropas Komisijas deklarācijai "1+ miljons genomu deklarācija" (turpmāk – 1+MG), kas paredz izveidot vismaz viena miljona Eiropas iedzīvotāju visa genoma sekvences kohortu. Tā mērķis ir nodrošināt pieejamību ģenētiskajiem un saistītajiem veselības datiem drošā un aizsargātā veidā veselības aprūpes (profilakse, diagnostika un ārstēšana), pētniecības un inovāciju nolūkos. Pētnieki un mediķi varēs analizēt un salīdzināt cilvēku ģenētisko un klīnisko informāciju. Tas palīdzēs agrāk atklāt slimības, prognozēt to attīstību un izlemt par labākajiem veidiem, kā uzlabot veselību. Šim mērķim starp 1+MG valstīm tiek veidots datu apstrādes ietvars. BMC sadarbībā ar Veselības ministriju un 21 citu Eiropas Savienības dalībvalsti piedalās projektā "Genomic Data Infrastructure" (turpmāk – GDI), kas tiek īstenots programmas "Digitālā Eiropa" ietvaros. GDI mērķis ir izveidot vienotu Eiropas genomisko datu infrastruktūru, nodrošinot tehnisko, tiesisko, ētisko un organizatorisko ietvaru drošai genomisko, klīnisko un citu ar veselību saistītu datu pārrobežu apmaiņai. Šī infrastruktūra nodrošinās vienotus datu standartus, drošības prasības un piekļuves mehānismus, tādējādi radot priekšnoteikumus Eiropas mēroga sadarbībai precīzijas medicīnā. GDI tieši atbalsta Eiropas iniciatīvu 1+MG. Izveidotā federētā datu infrastruktūra nodrošinās nacionālo genoma datu kolekciju drošu uzglabāšanu attiecīgajās valstīs un pārrobežu piekļuvi tām. Tāpat 1+MG iniciatīvas ietvaros tiek īstenots Eiropas Genoma projekts (The Genome of Europe Project - GoE), kuras ilgtermiņa mērķis ir pakāpeniski izveidot reprezentatīvu līdz 500 000 Eiropas iedzīvotāju references genoma kohortu, kas veidos pusi no Eiropas 1+MG. Latviju GoE projektā pārstāv BMC. Jānorāda, ka 2024. gada 5. novembra Ministru kabineta sēdē tika apstiprināts informatīvais ziņojums "Par valsts budžeta līdzfinansējuma pārdali no budžeta resora "74. Gadskārtējā valsts budžeta izpildes procesā pārdalāmais finansējums" programmas 80.00.00 "Nesadalītais finansējums Eiropas Savienības politiku instrumentu un pārējās ārvalstu finanšu palīdzības līdzfinansēto projektu un pasākumu īstenošanai" Eiropas Savienības programmas "Digitālā Eiropa" līdzfinansētā projekta "The Genome of Europe" īstenošanai", kas cita starpā paredz valsts budžeta līdzfinansējuma piešķiršanu GoE īstenošanai, paredzot 151 686 eiro (50% no projekta izmaksām) piešķiršanu BMC.Vienlaikus jāmin, ka 4.1.1.r. reformas projektā "Latvijas iedzīvotāju genoma references izveide" tika iegūta Latvijas iedzīvotāju genoma reference, iesaistot 3500 Latvijas iedzīvotājus un veicot ģenētiskā materiāla iegūšanu un pilnu genomu sekvencēšanu. Latvijas iedzīvotāju genoma references datu uzglabāšanai, apstrādei un piekļuves nodrošināšanai nepieciešama arī atbilstoša IKT infrastruktūra un datu apstrādes ietvars. Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna izstrādes laikā tika nolemts visus IKT projektus iekļaut 2. komponentē "Digitālā transformācija", tādēļ informācijas tehnoloģiju infrastruktūras izveide Latvijas iedzīvotāju references genoma glabāšanai un piekļuves nodrošināšanai tiek īstenota kā atsevišķs projekts. Atbilstoši Ministru kabineta 2022. gada 14. jūlija noteikumu Nr. 435 "Eiropas Savienības Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna 2. komponentes "Digitālā transformācija" 2.1. reformu un investīciju virziena "Valsts pārvaldes, tai skaitā pašvaldību, digitālā transformācija" īstenošanas noteikumi" 4. pielikumam šis projekts tiks īstenots 2.1.3.1.i. investīcijas nolūka "Ārstniecības iestāžu procesu digitālā transformācija un ārstniecības procesā radīto datu pārvaldība" ietvaros.Iepriekš minētās aktivitātes sekmēs 1+MG mērķa īstenošanu, radot iespējas sasaistīt genoma sekvenēšanas datus ar klīnisko informāciju. Tas dos ārstniecības speciālistiem iespēju precīzāk prognozēt, savlaicīgi atklāt un novērst slimības, kā arī nodrošināt efektīvāku un personalizētāku pacientu ārstēšanu, ņemot vērā katra pacienta ģenētiskās īpatnības. Tāpat iepriekš minētās aktivitātes radīs priekšnosacījumus drošai pārrobežu datu apmaiņai, veicinot starptautisko sadarbību pētniecībā un paverot iespējas padziļinātai plaša spektra slimību izpētei un to sasaistīšanai ar klīnisko informāciju, tostarp onkoloģisko, hronisko, reto un ultra-reto slimību gadījumā. |
| 3.3. Projekta ieguvumi1 | Ieguvuma mērīšanas vai verificēšanas metode un mērāmais rādītājs2 |
| 3.3.1. Ieguvums nozarei:Piekļuve reprezentatīvai valsts iedzīvotāju genomu datu kopai, nodrošinot atbalstu datu apstrādei, kas nepieciešama 1+MG īstenošanai un ilgtspējīgas nozares politikas plānošanai | Jauna nozares datu piekļuves un analīzes informācijas sistēma. Nodrošinot genoma references un citu ārstniecības procesa ietvaros iegūto genoma datu sekundārās izmantošanas pieejamību, ievērojami samazināsies nepieciešamība veikt atkārtotas genoma analīzes. Genoma datu references izmantošana hronisko slimību skrīninga un terapijas optimizācijai, izmantojot ģenētiskā riska aprēķinus, ilgtermiņā veidos būtisku proporciju no dzīvildzes palielināšanas. Optimizējot reto slimību un vēža diagnostiku, tiks paaugstināta pacientu dzīvildze.Genoma datu apstrāde VIGDIS sistēmā ir balstīta uz personas datu piekrišanu tās datu apstrādes veikšanai. Attīstāmā personas datu apstrādes piekrišanas funkcionalitāte būs pieejama citām biobankām un laboratorijām kā bezmaksas koplietošanas risinājums, kas atvieglos genoma datu apstrādes piekrišanu datu apriti vienotā datu struktūrā, kā arī, veicinās piekrišanas datu pieejamību ārstniecības iestādēm, pētniecības organizācijām un iedzīvotājiem.Ar mērķi ierobežot nepieciešamību veikt sensitīvo cilvēka genoma datu apstrādi ārpus uzraudzītas un kontrolētas vides, VIGDIS sistēmā tiek iekļauti jau esoši atvērtā koda rīki, lai nodrošinātu datu apstrādes un analītikas spējas. Šāda rīku pieejamība VIGDIS sistēmā palielina drošību genoma datu apstrādes procesā, nodrošinot kontrolētu datu pieejamību gan ārstiem, gan pētniekiem, minimizējot risku iedzīvotāju genoma datu neautorizētai apstrādei. Vienlaicīgi datu apstrādes un analītikas rīku pieejamību VIGDIS sistēmā veicinās plašāku genoma datu izmantošanu ārstniecības procesā, ļaujot ārstniecības personālam tūlītēju piekļuvi genoma datu analītikas iespējām, veicinot personalizētās medicīnas attīstību, ieviešot jaunus ārstniecības pakalpojumus un uzlabojot esošos. |
| 3.3.2. Ieguvums nozarei:Valsts iedzīvotāju genoma datu informācijas sistēma – valsts informācijas sistēma, kas reģistrētiem lietotājiem (ārstiem, veselības aprūpes darbiniekiem un pētniekiem) nodrošinās piekļuvi genoma datiem slimību diagnostikai un pētniecībai | Reģistrēto lietotāju skaits, kas izmantos informācijas sistēmu |
| 3.3.3. Ieguvums iestādei:Izveidota datu apstrādes rīku kopa, kas nepieciešama zinātniskajai izpētei un dalībai 1+MG projektos | Izveidotie datu apstrādes rīki dos iespēju ietaupīt genoma datu apstrādei nepieciešamos augstas veiktspējas skaitļošanas resursus un procesiem nepieciešamās cilvēkstundas |
| 3.3.4. Ieguvumi sabiedrībai:Projekta dalībniekiem nodrošināta piekļuve savu genomu datiem | Projektā iesaistītie iedzīvotāji, kuriem tiks nodrošināta piekļuve datiem |
| 4.1. Atveseļošanas un noturības mehānisma plāna finansējums (kopā) | 4.2. Plānotais pievienotās vērtības nodokļa (PVN) apmērs (kopā), ja tiks pieprasīta tā segšana3, un avansa apmērs, ja plānots to pieprasīt4 |
| --- | --- |
| 954 755,00 euro | 132 300,00 euro |
| Projekta ietvaros veicamo darbību un būtisko izmaksu veidu raksturojošs apzīmējums | Izmaksu apmērs (indikatīvi) |
| --- | --- |
| 4.3. Projekta vadības un īstenošanas personāla izmaksas | 80 124,35 euro |
| 4.4. Valsts iedzīvotāju genoma datu informācijas sistēmas izstrāde un Latvijas iedzīvotāju genoma references datu kopas uzglabāšana | 874 630,65 euro |
| Skaits | IKT risinājuma nosaukums | Īss apraksts6 | Valsts mākonī (jā/nē) | Termiņš IKT risinājumu attīstības saskaņošanai7 (gads, ceturksnis) | Termiņš ieviešanai produkcijā (gads, ceturksnis) | Risinājuma lietotāji (skaits) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 5.1.1. Valsts iedzīvotāju genoma datu informācijas sistēma | IKT risinājums, lai nodrošinātu drošu piekļuvi genoma references datiem | Jā | VARAM 27.11.2023. atzinums Nr. 11-1/6876)Izmaiņas tiek skaņotas. | 2026. gada II cet., bet ne ilgāk kā līdz 31.05.2026. | >100 | |
| Skaits | Pakalpojums (pakalpojumu grupa) | Koplietošanas pakalpojumu lietotāji (institūcijas) | Norāde uz MK lēmumu par attīstības plānu8 | Termiņš ieviešanai (gads, ceturksnis) | ||
| --- | --- | --- | --- | --- | ||
| N/A | N/A | N/A | N/A | |||
| Skaits | Saturu raksturojošs nosaukums | Termiņš piekļuves nodrošināšanai (gads, ceturksnis) | ||||
| --- | --- | --- | ||||
| 5.3.1. 3500 Latvijas iedzīvotāju pilna genoma secību raksturojošas jēldatu un sekundāro datu datnes | 2026. gada II cet., bet ne ilgāk kā līdz 31.05.2026. |
| BMC ir plaša pieredze Eiropas Savienības struktūrfondu projektu īstenošanā, sākot jau ar ES struktūrfondu un Kohēzijas fonda 2004.–2006. gada plānošanas periodu. Kopumā BMC šajā laikā ir īstenojis vairāk nekā 80 projektus, kas ietver gan pētniecības, gan institucionālās pārvaldības kapacitātes stiprināšanas, gan infrastruktūras izveides un pilnveides projektus. BMC ir pieejami kvalificēti cilvēkresursi ar ilggadēju pieredzi projektu vadībā un īstenošanā. BMC ir izveidots projektu vadības mehānisms, kas aptver gan konkrētā projekta izpildes vadību, gan tā administratīvo vadību. Par konkrētā projekta izpildes vadību ir atbildīgs projekta vadītājs, kas nodrošina projekta mērķu un uzdevumu sasniegšanu, savukārt BMC administratīvās struktūrvienības veic gan projektam nepieciešamo iepirkumu organizēšanu (iepirkumu un sagādes daļas vadītājs, iepirkumu speciālists), gan finanšu plānošanu (direktora vietnieks finanšu un administratīvajos jautājumos, finanšu un grāmatvedības daļas vadītājs (galvenais grāmatvedis, grāmatvedis)), gan nepieciešamo atskaišu sagatavošanu uzraugošajām iestādēm (projektu un attīstības daļas vadītājs, projektu vadītāji (2 amata vietas)). Šāda pienākumu sadale, kā arī savstarpējais atbalsts un mijiedarbība veicina projektu efektīvāku un kvalitatīvāku īstenošanu un mērķu sasniegšanu. Ilggadējās BMC pieredzes projektu vadībā laikā ir izstrādāti arī mehānismi projektu finanšu pārvaldībai un stabilas finanšu plūsmas nodrošināšanai. Ja to pieļauj projektu īstenošanu regulējošie normatīvie akti un noslēgtais līgums, projektu uzsākšanai BMC izmanto avansa maksājumu. Lai nodrošinātu vienmērīgu finanšu plūsmu, tiek plānoti projekta ietvaros veicamie izdevumi atbilstoši maksājumu pieprasījumu grafikam. Ja projektu īstenošanas ietvaros starp starpposmu maksājumiem ir nepieciešams veikt priekšfinansējumu projekta darbību īstenošanai, tad tas tiek veikts no BMC līdzekļiem, regulāri atvēlot tam finansējumu BMC ikgadējā budžetā. Ja projektu īstenošanu regulējošie normatīvie akti nosaka, ka starpposma maksājumos izmaksas ir veicamas līdz kādai procentuālai robežai (piemēram, ES struktūrfondu projektos tie ir 90 % no ES un valsts budžeta līdzekļiem), tad BMC priekšfinansējuma nodrošināšanai, ja nepieciešams, izmanto valsts aizdevumu, kuru atmaksā uzreiz pēc gala maksājuma saņemšanas |
|---|
Šis dokuments neaizstāj oficiālo publikāciju izdevumā Latvijas Vēstnesis. Mēs neuzņemamies atbildību par iespējamām neprecizitātēm, kas radušās oriģināla pārveidošanā šajā formātā.